Die einzige Windows Store App, die ich zugunsten der eigenständigen Version verwende, ist Spotify. Daher weiß ich nicht, ob dies auf alles zutrifft, aber die Spotify Version im Windows Store aktualisiert sich automatisch nahtlos, ohne mich jemals um etwas zu bitten. Ich gehe davon aus, dass es das Update installiert, sobald es verfügbar ist, aber nur zur neuen Version wechselt, wenn ich Spotify beende oder meinen Computer neu starte.
Wenn dies für die meisten Dinge im Windows Store gilt, denke ich, dass das ein ziemlich guter Grund ist, ihn für Dinge zu verwenden, die häufig aktualisiert werden, anstelle von eigenständigen Versionen.